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生物医药产业增加智能测序新场景

2020-09-23 10:58   来源: 互联网

GMP 生产车间正在建设中,实验室已经竣工,正在等待验收,新装修的办公区已经投入使用。9 月 18 日,记者在玉国生物技术(北京)有限公司看到。有限公司(以下简称 "育国生物学") 进入园区后不久,公司总部和 GMP 车间经过前期的紧张准备,占地 4000 多平方米,离投入使用还有一步之遥,标志着科技部 "十三五" 国家重点研究开发项目中唯一的病原学宏观基因组测序企业将在经济技术领域实现创新发展。


致病大基因组


测序样本排在第一位


通过大基因组测序(MNGS),发现了一种新的冠状病毒。MNGS 常用于检测和确认未知病原体,或用于检测或研究样品中所有可能感染的微生物。余国首席执行官夏寒说,如不明原因的感染诊断,混合感染,继发性感染,以及不同部位的感染,如中枢神经系统感染、呼吸系统感染、血流感染、胸腔和腹腔感染、难治性感染和危重感染等。该技术的应用和推广对于提高生物安全性,及时发现未知的临床感染类型,减少抗生素的使用,提高医疗质量具有重要的意义。


在疫情期间,裕国生物学通过 mNGS 技术为陕西省最危险再冠患者的诊断和治疗提供了技术支持,通过测序技术,为患者提供了 1600 页病历和 49 天 ECMO 手术的准确的病原体诊断和用药方案,为患者的康复做出了重大贡献。


据了解,玉果生物学致力于国家支持的生物技术和人工智能领域,并通过技术组合进行有效改造。通过大基因组检测技术,检测体液(脑脊液、胸腔积液、胸腔积液、血液、痰等),获得大量病原微生物数据,建立致病微生物平台大数据PACEseq.PACEseq平台,采用多壁破壁、多宿主清除技术,利用机器学习算法建立自研数据库,便于病原诊断。


此外,育国生物拥有中国最大的单一脑脊液标本库,现有标本2万多个;参与建立了全国神经感染和相关疾病网络登记系统;并拥有近20个第二代测序程序和计算机集群。"于国生物参加了第一批"十三五"精密医学重点专项项目--传染性脑膜脑膜炎病原学分类专项研究。同时,玉国生物学也建立了一个全基因组联合实验室,该公司拥有中国最大的致病性基因组退化数据库。于国团队在第三代测序机的ont平台上也有着深厚的积累。


高水平的建设实现了高质量的发展。夏寒说,目前,大基因组测序检测的样本数量是世界上最高的,其中脑脊液排在世界前两位,样本总数在中国排在第二位。目前,公司为全国300多家A级医院提供检测服务。


该公司在广州、上海和南京设有基因测序实验室,是西安最大的微生物测序中心。国家实验室和植物区的预果生物面积将达到8000平方米,生物安全水平将达到P2水平。


列出第一个智能测序场景


开放实验室


今年5月,玉国生物学与北京致远人工智能研究所在京开区运营总部联合推出了"北京新一代人工智能创新开发实验区-智能测序现场开放实验室",标志着下一代微生物基因组数据库标准的研究与创新算法开发进入了一个新的时代。


作为中国第一个获得许可的单位,裕国生物学与中国顶尖的人工智能研究所北京致远人工智能研究所合作,将该公司开发的云致病微生物数据分析系统的速度引擎升级到更复杂、更精确的人工智能方向,并在更大程度上提高现有的诊断水平。

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夏寒说,双方共同开发的"智能测序场景开放试验区"的定位,是探索人工智能技术在生物技术特别是测序数据分析中的应用方法和技术,提出新的概念和模型,构建相应的系统和场景。


按照该计划,"智能测序场景开放实验区"的目标是在人工智能和生物技术相结合方面取得国际领先成果,培养和收集与人工智能和生物技术有关的创新人才,构建人工智能在生物技术中的智能应用场景,以便在更多的项目和应用中发挥领导和示范作用。


智能测序场景测试区将为基因测序提供更强大的人工智能技术支持。期望产生更先进的算法引擎,以及相应的智能排序模型,然后集成到一个完整的排序平台中,更好地应用人工智能技术在智能排序场景中的应用。夏寒说:"通过智能测序场景实验区的建设,为更多的人工智能+医学应用场景提供了一个示范模型。




责任编辑:萤莹香草钟
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